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2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

黎明强 黄萍 陈柳军 余钧池 刘鑫 冯献湘

黎明强, 黄萍, 陈柳军, 余钧池, 刘鑫, 冯献湘. 2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2016, 20(8): 781-784. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007
引用本文: 黎明强, 黄萍, 陈柳军, 余钧池, 刘鑫, 冯献湘. 2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2016, 20(8): 781-784. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007
LI Ming-qiang, HUANG Ping, CHEN Liu-jun, YU Jun-chi, LIU Xin, FENG Xian-xiang. Study on distribution of partial HIV-1 strains subtypes in Liuzhou City from 2011 to 2013 by gene gag sequencing[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2016, 20(8): 781-784. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007
Citation: LI Ming-qiang, HUANG Ping, CHEN Liu-jun, YU Jun-chi, LIU Xin, FENG Xian-xiang. Study on distribution of partial HIV-1 strains subtypes in Liuzhou City from 2011 to 2013 by gene gag sequencing[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2016, 20(8): 781-784. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007

2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007
基金项目: 

广西科学技术厅立项课题(1140003A-44)

详细信息
    作者简介:

    黎明强(1961-),男,广西柳州人,主任医师,学士。主要研究方向:公共卫生管理和艾滋病防治;黄萍(1986-),女,壮族,广西柳州人,主管技师,硕士。主要研究方向:分子流行病学和功能基因组学。

  • 中图分类号: R512.91;R181

Study on distribution of partial HIV-1 strains subtypes in Liuzhou City from 2011 to 2013 by gene gag sequencing

  • 摘要: 目的 了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1, HIV-1)亚型分布、流行毒株情况。方法 从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序。合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树。结果 得到合格的gag基因片段98条序列。来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株(circulate recombinant forms, CRFs)的重组亚型CRF01_AE占95.9%(94/98),异性传播比例为79.8%(75/94);重组亚型CRF07_BC占4.1%(4/98)。样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0%,100.0%,两两之间传播途径不同。结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01_AE为主。柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延。利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证。
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  • 收稿日期:  2016-04-26
  • 修回日期:  2016-06-05

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