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摘要: 目的探讨戊型肝炎病毒基因重组及其对病毒抗原性的影响。方法收集HEV基因全序列,经过对齐、去除空位处理后,运用RDP2.0软件进行筛查,然后利用SimPlot3.5.1软件进行相似性分析和BOOTSCAN分析,对基因重组加以验证,并构建最大似然比进化树,观察重组片断拓扑结构的改变。结果利用RDP2.0软件共检测到3个重组序列,分别是AF459348、D11093、D11092,都是I型HEV。相似性分析和BOOTSCAN分析都显示D11093、D11092重组是有统计学意义的,重组片断最大似然进化树的拓扑结构也发生了改变,都发生在I型ORF1区。地缘分析表明D11092是基因重组的产物,而D11093极有可能是实验室内发生的重组。结论HEV进化过程中也存在重组,主要发生在I型ORF1区;HEV基因重组对于未来HEV抗原性改变可能影响不大。
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