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148株柯萨奇病毒A组16型的多序列比对及遗传进化分析

高风华 郭中敏 陆家海

高风华, 郭中敏, 陆家海. 148株柯萨奇病毒A组16型的多序列比对及遗传进化分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2012, 16(5): 400-403.
引用本文: 高风华, 郭中敏, 陆家海. 148株柯萨奇病毒A组16型的多序列比对及遗传进化分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2012, 16(5): 400-403.

148株柯萨奇病毒A组16型的多序列比对及遗传进化分析

详细信息
  • 中图分类号: R373.23

  • 摘要: 目的进一步了解中国大陆柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CoxA16)毒株的变异情况和遗传进化规律,为手足口病的预防和控制奠定基础。方法对美国国立生物技术信息中心(NCBI)中收录的分离自中国大陆的CoxA16毒株序列用DNAStar 5.0软件进行同源性比较、氨基酸变异分析及遗传进化分析。结果 CoxA16的A、B、C 3个基因型已全部在中国大陆出现过流行,近年来以B、C型为主;病毒进化比较保守,但与原型株已有较大差异,同一地区和时间分离的病毒同源性很高;2007年以来分离毒株数量明显增多,广东、甘肃、山东地区分离数量较多。结论 CoxA16相对保守,但已出现一定程度的变异。
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