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阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析

赵蕾 陈敬贤 王明丽

赵蕾, 陈敬贤, 王明丽. 阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2013, 17(6): 480-483.
引用本文: 赵蕾, 陈敬贤, 王明丽. 阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2013, 17(6): 480-483.

阜阳市手足口病柯萨奇病毒A10型VP4区基因特征分析

基金项目: 国家自然科学基金(30872253); 安徽省科技厅科技攻关项目(8010302179);
详细信息
  • 中图分类号: R373

  • 摘要: 目的分析2011-2012年阜阳市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿咽拭子标本分离的柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CoxA10)VP4区的基因特征,初步了解该病毒的变异情况。方法对49份HFMD患儿的咽拭子标本进行病毒分离,出现人肠道病毒(human enterovirus,HEV)特征性病毒致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE)后提取病毒RNA,用VP4区分型引物进行半巢式反转录-PCR,再通过测序和GenBank Blast比对确定病毒型别,并对其VP4区进行序列进化分析。结果 49份咽拭子标本有16份出现了特征性CPE,病毒分离阳性率32.7%。其中三株经鉴定为CoxA10,阳性率18.8%。它们的VP4区核苷酸序列同源性为95%~99%,与GenBank中参考毒株VP4区核苷酸序列同源性为77%~97%。其中与中国株HQOO5431同源性为96%~97%,与中国株JN639887同源性为96%~97%,与中国株FJ598089同源性为95%~96%,与日本株AB282808同源性为8...
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