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扬州市戊型肝炎病毒基因特征分析

肖越胜 张军 黄瑶 姜辉

肖越胜, 张军, 黄瑶, 姜辉. 扬州市戊型肝炎病毒基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2014, 18(7): 597-600.
引用本文: 肖越胜, 张军, 黄瑶, 姜辉. 扬州市戊型肝炎病毒基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2014, 18(7): 597-600.

扬州市戊型肝炎病毒基因特征分析

基金项目: 江苏省预防医学科研课题(Y2012011);
详细信息
  • 中图分类号: R512.6

  • 摘要: 目的分析扬州市戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的基因特征。方法采用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-nested polymerase chain reaction,RT-nPCR)法筛选人抗戊型肝炎(hepatitis E,HE)病毒抗体免疫球蛋白m(immunoglobulin m,IgM)阳性血清和猪肝组织样品,套式RT-PCR扩增HEV RNA ORF2片段基因并测序,DNA Star MegAlign比对核苷酸构建距离矩阵和系统发生树。结果筛查并扩增6株基因4型HEV病毒,核苷酸同源性89.9%99.3%,与基因4型参考株的同源性为85.8%94.6%,与其他基因型的同源性为79.1%89.2%,遗传进化显示扬州市6株病毒分在3个基因亚型分支上,与基因2型和3型的遗传距离大于基因1型。结论扬州地区人源和猪源HEV同源性高,HE的传染源是猪的可能性大。
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