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2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

李静 李国明 雷亚克 杨朝晖 张婷 占建波

李静, 李国明, 雷亚克, 杨朝晖, 张婷, 占建波. 2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2015, 19(8): 760-764. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2015.08.002
引用本文: 李静, 李国明, 雷亚克, 杨朝晖, 张婷, 占建波. 2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2015, 19(8): 760-764. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2015.08.002

2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2015.08.002
基金项目: “十二五”国家科技重大专项(2012ZX10004207); 湖北省医学领军人才培养工程(2014年);
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  • 中图分类号: R373.11

  • 摘要: 目的分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型别以及血凝素蛋白(H)基因特性。方法对2012-2013年麻疹病毒核酸检测阳性的患者标本,直接提取核酸,采用one-step逆转录—聚合酶链反应方法扩增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,测序后进行同源性和进化分析。结果湖北省麻疹病毒流行株主要为H1基因型的H1a亚型,发现一株D8基因亚型。与中国麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比较,其核苷酸同源性分别为91.6%92.4%和94.6%94.8%。对湖北省H1a亚型麻疹病毒H基因进化分析发现均属lineage 3b,H蛋白序列分析发现第240和第397位氨基酸分别发生Ser→Asn、Pro→Leu的变异。运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法,估计H1a基因亚型H基因核苷酸的平均碱基替代率为7.619×10-4取代/位点/年,估算其共同祖先大约出现在1980年。结论湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,仅1例D8亚型;与中国疫苗株沪191株相比较,两者在基因特性上存在明显差异,需进一步加强对麻疹病毒基因型别和变异程度的监测。
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