东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析

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东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析

伦玉华, 罗皓, 方晓君, 朱建琼, 杨华可, 杜进林, 倪进东

文章导航 > 中华疾病控制杂志 > 2018 > 22(12): 1297-1299

伦玉华, 罗皓, 方晓君, 朱建琼, 杨华可, 杜进林, 倪进东. 东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

引用本文:

伦玉华, 罗皓, 方晓君, 朱建琼, 杨华可, 杜进林, 倪进东. 东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

LUN Yu-hua, LUO Hao, FANG Xiao-jun, ZHU Jian-qiong, YANG Hua-ke, DU Jin-lin, NI Jin-dong. Subtype and sequence analysis of pol gene among HIV-1 strains in Dongguan[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

Citation:

LUN Yu-hua, LUO Hao, FANG Xiao-jun, ZHU Jian-qiong, YANG Hua-ke, DU Jin-lin, NI Jin-dong. Subtype and sequence analysis of pol gene among HIV-1 strains in Dongguan[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

伦玉华, 罗皓, 方晓君, 朱建琼, 杨华可, 杜进林, 倪进东. 东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

引用本文:

伦玉华, 罗皓, 方晓君, 朱建琼, 杨华可, 杜进林, 倪进东. 东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

LUN Yu-hua, LUO Hao, FANG Xiao-jun, ZHU Jian-qiong, YANG Hua-ke, DU Jin-lin, NI Jin-dong. Subtype and sequence analysis of pol gene among HIV-1 strains in Dongguan[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

Citation:

LUN Yu-hua, LUO Hao, FANG Xiao-jun, ZHU Jian-qiong, YANG Hua-ke, DU Jin-lin, NI Jin-dong. Subtype and sequence analysis of pol gene among HIV-1 strains in Dongguan[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2018, 22(12): 1297-1299. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

东莞市HIV-1流行株pol基因序列特征和亚型分析

doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2018.12.022

伦玉华¹,
罗皓^2,3,
方晓君¹,
朱建琼¹,
杨华可¹,
杜进林^2,3,
倪进东^2,3, ,

1. 东莞市疾病预防控制中心艾滋病预防控制所, 广东东莞 523129;
2. 广东医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室, 广东东莞 523808;
3. 广东医科大学环境与健康研究所, 广东东莞 523808

基金项目:

广东省科技计划项目（2014A020212458）

作者简介:
伦玉华(1982-),女,广东东莞人,主管技师,学士。主要研究方向:从事艾滋病等检测工作。

中图分类号: R373.51;R342.26
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- 被引次数: 0
出版历程
- 收稿日期: 2018-01-22
- 修回日期: 2018-08-30

Subtype and sequence analysis of pol gene among HIV-1 strains in Dongguan

摘要: 目的了解东莞市人类免疫缺陷病毒Ⅰ型（human immunodeficiency virus type 1，HIV-1）感染者的流行病学特征及亚型的分布情况。方法选取50例样本，收集流行病学资料，采用RT-PCR法扩增pol基因序列并测序，应用BioEdit、Genotyping和MEGA等生物学软件对pol基因进行序列分析。结果收集的50例样本最终成功扩增得到32份样本的pol基因序列，其中CRF01_AE亚型12例；CRF_07BC亚型11例；B亚型7例；CRF55_01B亚型2例。各亚型基因离散率分别为CRF01_AE是（0.075±0.039）、CRF07_BC是（0.030±0.009）、B亚型是（0.073±0.022），各亚型之间的基因离散率差异有统计学意义（F=41.055，P<0.001），CRF01_AE亚型和B亚型内毒株间的基因离散率均大于与CRF07_BC亚型（P值均小于0.001）。结论 CRF01_AE和CRF_07BC亚型在东莞市HIV-1流行株中占优势，CRF07_BC亚型在各亚型之间的基因离散率最小。
- 人类免疫缺陷病毒1型 /
- 基因变异 /
- 序列分析

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