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安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析

晏开力 赵月萍 陈晓琴 周淑洁 陈霞 刘丹青 沈永刚 任军

晏开力, 赵月萍, 陈晓琴, 周淑洁, 陈霞, 刘丹青, 沈永刚, 任军. 安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2009, 13(5): 516-519.
引用本文: 晏开力, 赵月萍, 陈晓琴, 周淑洁, 陈霞, 刘丹青, 沈永刚, 任军. 安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2009, 13(5): 516-519.

安徽省肠道病毒71型VP1区基因分析

详细信息
  • 中图分类号: R725.125.7

  • 摘要: 目的阐述引起安徽省2008年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型(enterovirus71,EV71)基因特征。方法采集HFMD暴发初期患者标本,进行病毒分离、培养,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定上述培养物。扩增病毒株及核酸样本的VP1编码区全基因,并进行序列测定和分析。结果暴发初期分离出3份病毒株,经中和试验及RT-PCR证实为EV71。根据VP1全基因序列与EV71基因型、亚型参考株构建亲缘性关系树,17份测序结果与C4亚型聚为一簇,与A、B、C1、C2、C3、C4基因型别(亚型)的核苷酸的同源性分别为:82.0%83.0%、84.3%85.4%、89.7%91.1%、89.1%90.7%、88.3%89.8%、93.0%94.6%;氨基酸的同源性分别为:93.9%95.2%、96.6%97.6%、97.9%98...
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