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江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

姚学君 单军 嵇红 李靖欣 张雪峰 朱凤才

姚学君, 单军, 嵇红, 李靖欣, 张雪峰, 朱凤才. 江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2016, 20(5): 481-485. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.05.013
引用本文: 姚学君, 单军, 嵇红, 李靖欣, 张雪峰, 朱凤才. 江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2016, 20(5): 481-485. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.05.013
YAO Xue-jun, SHAN Jun, JI Hong, LI Jing-xin, ZHANG Xue-feng, ZHU Feng-cai. Analysis on molecular epidemiology of Coxsackievirus A16 strains isolated from 2012 to 2014 in Jiangsu Province[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2016, 20(5): 481-485. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.05.013
Citation: YAO Xue-jun, SHAN Jun, JI Hong, LI Jing-xin, ZHANG Xue-feng, ZHU Feng-cai. Analysis on molecular epidemiology of Coxsackievirus A16 strains isolated from 2012 to 2014 in Jiangsu Province[J]. CHINESE JOURNAL OF DISEASE CONTROL & PREVENTION, 2016, 20(5): 481-485. doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.05.013

江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

doi: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.05.013
基金项目: 

“十二五”国家科技重大专项(2012ZX1002-001);国家自然科学基金青年基金(81402732)

详细信息
    作者简介:

    姚学君(1987-),男,江苏盐城人,医师,硕士。主要研究方向:传染病流行病学;单军(1979-),女,山东兖州人,副主任技师,硕士。主要研究方向:病原微生物学。

  • 中图分类号: R512.57;R394.21;R181

Analysis on molecular epidemiology of Coxsackievirus A16 strains isolated from 2012 to 2014 in Jiangsu Province

  • 摘要: 目的 了解江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)流行毒株基因型概况。方法 收集江苏省2012-2014年儿童手足口病标本并送样,进行病毒分离培养获取相应毒株,用CA16特异性引物通过反转录聚合酶链反应技术进行VP1区基因片段扩增和测序,利用生物信息学软件对序列进行分析,并与CA16参比株序列进行同源性比较并构建基因进化树。结果 分离得到82株CA16毒株,测序结果显示全部属于基因亚型B1,VP1基因分析显示其中9株毒株序列的基因亚型为B1a,另外73株毒株序列的基因亚型为B1b。CA16分离株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为87.8%~100.0%和97.5%~100.0%;与CA16国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别为75.2%~78.2%和90.5%~91.9%。结论 江苏省2012-2014年分离获得CA16毒株属于基因亚型B1,以B1a和B1b两个分支共同进化和流行,其中又以B1b为优势亚型。
  • Wang J, Cao Z, Zeng DD, et al. Epidemiological analysis, detection, and comparison of space-time patterns of Beijing hand-foot-mouth disease (2008–2012) [J]. PLoS One, 2014,9(3):e92745.
    Nguyen NTB, Pham HV, Hoang CQ, et al. Epidemiological and clinical characteristics of children who died from hand, foot and mouth disease in Vietnam, 2011 [J]. BMC Infect Dis, 2014,14:341.
    Liu W, Wu S, Xiong Y, et al. Co-circulation and genomic recombination of coxsackievirus A16 and enterovirus 71 during a large outbreak of hand, foot, and mouth disease in Central China [J]. PLoS One, 2014,9(4):e96051.
    Samphutthanon R, Tripathi NK, Ninsawat S, et al. Spatio-temporal distribution and hotspots of Hand, Foot and Mouth disease (HFMD) in northern Thailand [J]. Int J Environ Res Public Health, 2013,11(1):312-336.
    Mao LX, Wu B, Bao WX, et al. Epidemiology of hand, foot, and mouth disease and genotype characterization of Enterovirus 71 in Jiangsu, China [J]. J Clin Virol, 2010,49(2):100-104.
    Yeo WM, Chow VT. The VP1 structural protein of enterovirus 71 interacts with human ornithine decarboxylase and gene trap ankyrin repeat [J]. Microb Pathog, 2007,42(4):129-137.
    Liu SL, Pan H, Liu P, et al. Comparative epidemiology and virology of fatal and nonfatal cases of hand, foot and mouth disease in mainland China from 2008 to 2014 [J]. Rev Med Virol, 2015,25(2):115-128.
    Goldberg MF, McAdams AJ. Myocarditis possibly due to Coxsackie group A, type 16, virus [J]. J Pediatr, 1963,62(5):762-765.
    Wang CY, Li Lu FL, Wu MH, et al. Fatal coxsackievirus A16 infection [J]. Pediatr Infect Dis J, 2004,23(3):275-276.
    Zhou HT, Wang B, Che XY. Nephrotic syndrome in hand, foot and mouth disease caused by coxsackievirus A16: a case report [J]. Int J Infect Dis, 2014,28:1-2.
    Ogilvie MM, Tearne CF. Spontaneous abortion after hand-foot-and-mouth disease caused by Coxsackie virus A16 [J]. Br Med J, 1980,281(6254):1527-1528.
    Goto K, Sanefuji M, Kusuhara K, et al. Rhombencephalitis and coxsackievirus A16 [J]. Emerg Infect Dis, 2009,15(10):1689-1691.
    Li L, He Y, Yang H, et al. Genetic characteristics of human enterovirus 71 and coxsackievirus A16 circulating from 1999 to 2004 in Shenzhen, People's Republic of China [J]. J Clin Microbiol, 2005,43(8):3835-3839.
    Perera D, Yusof MA, Podin Y, et al. Molecular phylogeny of modern coxsackievirus A16 [J]. Arch Virol, 2007,152(6):1201-1208.
    Puenpa J, Theamboonlers A, Korkong S, et al. Molecular characterization and complete genome analysis of human enterovirus 71 and coxsackievirus A16 from children with hand, foot and mouth disease in Thailand during 2008-2011 [J]. Arch Virol, 2011,156(11):2007-2013.
    Mizuta K, Abiko C, Aoki Y, et al. Molecular epidemiology of Coxsackievirus A16 strains isolated from children in Yamagata, Japan between 1988 and 2011 [J]. Microbiol Immunol, 2013,57(5):400-405.
    Song JH, Park K, Yeo SG, et al. Complete sequence analysis and antiviral screening of medicinal plants for human coxsackievirus a16 isolated in Korea [J]. Osong Public Health and Res Perspect, 2015,6(1):52-58.
    Huang X, Wei H, Wu S, et al. Epidemiological and etiological characteristics of hand, foot, and mouth disease in Henan, China, 2008-2013 [J]. Sci Rep, 2015,5:8904.
    Zhang Y, Wang D, Yan D, et al. Molecular evidence of persistent epidemic and evolution of subgenotype B1 coxsackievirus A16-associated hand, foot, and mouth disease in China [J]. J Clin Microbiol, 2010,48(2):619-622.
    许玉玲,卫海燕,穆玉姣,等. 河南省 2010 年柯萨奇病毒 A 组 16 型 VP1 区基因特征分析 [J]. 中国病毒病杂志, 2011,1(3):200-203.
    曲梅,李洁,贾蕾,等. 北京市2009 年手足口病的病原构成及柯萨奇 A 组 16 型病毒基因特征分析 [J]. 病毒学报, 2010,26(6):432-436.
    王东艳,陈慧,严冬梅,等. 宁夏地区 2008 年柯萨奇病毒 A 组 16 型 VP1 区基因特征分析 [J]. 中华流行病学杂志, 2010,31(8):904-908.
    常新,周剑惠,刘桂艳,等. 吉林省 2009 年手足口病来源的柯萨奇病毒 A 组 16 型 VP1 编码区基因特征 [J]. 中国疫苗和免疫, 2013,18(6):536-540.
    高风华,郭中敏,陆家海. 148 株柯萨奇病毒 A 组 16型的多序列比对及遗传进化分析 [J]. 中华疾病控制杂志, 2012,16(5):400-403.
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  • 收稿日期:  2015-12-27
  • 修回日期:  2016-02-21

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